在细胞培养中，理想的水凝胶可以精确复制通常存在特定细胞类型的天然 ECM 的功能。选择用于细胞培养的水凝胶时要考虑的因素包括：
可调节性——是否可以轻松添加官能团，是否可以改变水凝胶的弹性（刚度）？
功能性——RGD 和层粘连蛋白等功能性基序是否可用？
生物降解性——通常需要允许细胞迁移。最终，细胞将产生自己的 ECM。然而，过快的降解可能没有足够的时间来实现这一点。生物降解性对于临床转化应用也很重要。
电荷——有时会被忽视，水凝胶的电荷会对特定细胞类型的适用性产生重大影响
易于处理——水凝胶需要与细胞混合，然后转移到培养孔中。一旦部署，可以使用化学或紫外线交联来实现这一点。细胞培养基中存在的离子还可以显着增加交联和凝胶硬度。
定义——尤其是动物源性水凝胶，是一个复杂的黑匣子，人们对它们对细胞的影响知之甚少。
可分析——应该可以从水凝胶中回收细胞进行分析，并且可以在细胞仍嵌入凝胶中时对其进行分析
无动物成分——动物源性水凝胶存在批次差异，存在严重的供应问题，无法轻易转化为临床，并且存在伦理挑战。
