着手调查OOS结果的根本原因，往往需要实验室利用深入的调查工具来排除其他潜在的原因，并就后续工作做出科学决策。OOS结果的一个例子是，一个产品的鲎试剂细菌内毒素检测限值<1 EU/mL，但回收率为2 EU/mL。所有OOS结果都需要进行调查，主要目的是确定是否存在可指出的原因或是否可以确定可指出的原因。OOS内毒素结果在患者安全方面尤其令人担忧，因为药品中有高含量的内毒素，如果被使用，会引起不良反应。因此，在放行或放弃药品批次之前调查这些结果并找到根本原因非常重要。本文引用了美国食品药品监督管理局（FDA）的《行业指南：调查药品生产的不合格（OOS）检测结果》（U.S. FDA Guidance for Industry: Investigating Out-of-Specification (OOS) Test Results for Pharmaceutical Production），本文旨在总结和回顾该指南。
OOS调查可分为两部分1：
第1阶段：实验室调查
第2阶段：全面的OOS调查
调查应从实验室开始，如果没有发现明显的实验室误差，则应对所有其他相关部门进行调查。OOS的第1阶段（实验室调查）应包括对实验室数据准确性的初步评估，包括审查分析人员的培训记录、检测表格、试剂到期、使用的设备和检测控制。如有可能，应在检测溶液制备之前就开始，如样品稀释的误差就被排除了1。这样，关于实验室误差或仪器故障的假设就可以使用相同的检测溶液制备来测试。
第2阶段的目标是在第1阶段的初始评估未确定实验室误差导致OOS的情况下，确定产品不合格的原因。该阶段可能包括生产过程审查和/或额外的实验室工作。此类调查的目标应该是确定OOS结果的根本原因并采取适当的纠正和预防措施（CAPA，Corrective Action & Preventive Action）1。在此阶段重新检测样品很重要，因为这可以确定是否真的存在OOS结果，或者过程中是否发生了某种类型的妥协。重新检测应由未执行初始检测的分析人员对同一样品的相等份量进行。在公司的标准操作程序（SOP）中应规定在调查启动和结束之前的重新检测次数。这将有助于避免检测合规，即对样品进行一定次数的检测，直到收到通过结果并且忽略OOS。如果重新检测确认了OOS结果，则有必要进一步深入生产过程和批次审查，以找到根本原因。这可能包括，例如，检查原材料或记录该特定批次的成分变化。建议使用鱼骨图（Ishikawa）或“5 Why分析法”等根本原因分析工具之一来确定OOS结果的根本原因。
QC实验室的控制状态非常重要。可以使用已建立的质量管理系统来控制过程，如培训、SOP和文件、调查、CAPA和过程监控。所有实验室都会生成和收集数据，如内毒素结果，这些数据可用于减少可变性并提高内毒素流程的有效性，例如在生产过程中通过下游和纯化工作来成功去除内毒素。调查对于分析和改进流程非常重要。使用根本原因分析工具（如鱼骨图或“5 Why分析法”）可以帮助实验室明确根本原因并确定OOS结果的严重程度。一旦对真正的OOS进行调查并确认或拒绝，质量控制和质量保证团队就可以决定后续工作——拒绝或接受并放行。
