在UASB反应器内，厌氧污泥可以以絮状的聚集体(絮状污泥) 存在，也可以以直径约 0.5~0.6mm 的球形或椭球形(颗粒污泥)存在。在厌氧反应器内颗粒污泥形成的过程称之为颗粒污泥化，颗粒污泥化是大多数 UASB 反应器启动的目标和启动成功的标志。
颗粒污泥的形成使 UASB 内可以保留高浓度的厌氧污泥。这首先是因为颗粒污泥具有ji好的沉降性能。絮状污泥沉降性能较差，当产气量较高、废水上流速度略高时，絮状污泥则容易冲洗出反应器。产与水流的剪切力也易于使絮状污泥进一步分散，这加剧了絮状污泥的洗出，而颗粒污泥有ji好的沉降性能，它能在很高的产气量和高上流速度下保留在厌氧反应器内。因此，污泥的颗粒化可以使 UASB 反应器允许有更高的有机物容积负荷和水力负荷。
由于厌氧微生物，特别是甲烷菌增殖很慢，厌氧反应器的启动需要较长的时间，这被认为是高速厌氧反应器的一个不足之处。但是，一旦初次启动完成，在停止运行后的再次启动可以迅速完成。当使用现有废水处理系统的厌氧颗粒污泥启动时，它要比其他任何高速厌氧反应器的启动都要快得多。
——洗出的污泥不再返回反应器；
——当进液 COD浓度大于5000mg/L 时采用出水循环或稀释进液；
——逐步增加有机负荷，有机负荷的增加应当在可降解 COD 能被去除 80% 后再进行；
——保持乙酸浓度始终低于1000mg/L；
——低浓度的废水有利于颗粒化的快速形成，但浓度也应当足够维持良好的细菌生产条件，最小的COD 浓度应为1000mg/L；
——过量的悬浮物会阻碍颗粒化的形成；
——溶解性碳水化合物为主要底物的废水比以 VEA 为主的废水颗粒化过程快，当废水含有蛋白质时应使蛋白质尽可能降解；
——在中温范围，最佳温度为38C ~40C，高温范围为50C ~60C；
——在反应器内的 pH 应始终保持在 6.2以上；
——营养物质和微量元素应当满足微生物生长的需要。
——毒性化合物应当低于抑止浓度或给予污泥足够的驯化和时间。
