环介导等温扩增（Loop-mediated Isothermal Amplification, LAMP）是一种高效的核酸扩增技术，广泛应用于医学诊断、环境监测和食品安全检测等领域。在进行LAMP反应之前，引物的设计是至关重要的一步，它决定了扩增的特异性和效率。那么，在LAMP引物设计时，我们输入的是mRNA还是DNA呢？
我们需要明确的是，LAMP技术是基于DNA的扩增技术。它利用四到六条特异引物识别靶DNA上的六个不同区域，在等温（通常为60-65°C）条件下，通过链置换DNA聚合酶的作用，在30分钟内可将靶DNA扩增到109-1010倍。因此，在LAMP引物设计时，我们输入的是DNA序列，而不是mRNA。
然而，在实际应用中，我们可能会遇到从mRNA开始的情况。mRNA是细胞中的信使RNA，它携带了DNA中的遗传信息，并指导蛋白质的合成。在某些情况下，我们可能希望从mRNA出发，检测特定的基因表达情况。此时，我们需要先将mRNA反转录成cDNA（互补DNA），然后再进行LAMP扩增。反转录是一个生物化学过程，通过反转录酶的作用，将mRNA中的核苷酸序列转化为DNA的核苷酸序列（cDNA）。在得到cDNA之后，我们就可以按照LAMP引物设计的原则，设计相应的引物，进行LAMP扩增。
在LAMP引物设计时，我们需要考虑多种因素。首先，引物的长度通常在18-30个碱基之间，过长或过短的引物都可能影响扩增的特异性和效率。其次，引物的Tm值（熔解温度）也是一个重要的参数，它决定了引物与模板之间的结合能力。此外，引物的GC含量、引物之间的互补性等因素也需要考虑。
总之，LAMP引物设计时输入的是DNA序列。虽然在实际应用中，我们可能会从mRNA出发进行检测，但需要先通过反转录将mRNA转化为cDNA，然后再进行LAMP扩增。在引物设计时，我们需要综合考虑多种因素，以确保扩增的特异性和效率。
