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大肠杆菌折戟沉沙,谁来拯救包涵体蛋白?

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2024/7/16 16:42:08

哈喽宝子们,我最近遇到了一个难缠的蛋白,用大肠杆菌表达后会出现在沉淀中。如果从沉淀中提取纯化,操作复杂姑且不论,还有可能没有活性!如果优化培养条件让它在上清中表达,需要慢慢摸索,费时费力还不一定成功。这几天为了思考解决办法,真是要茶饭不思了!

闭门造车不如出门取经,这不,我在万能的师兄这里求来了一样新“法宝”,据说它可以让包涵体蛋白在上清中表达。今天让我们一起来看一下它究竟“威能”如何吧!内含我的真实实验步骤+结果+操作Tips哦。


如何拯救包涵体蛋白?


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“法宝”显威——无细胞蛋白表达试剂盒初体验



一、使用前准备


打开试剂盒,让我们看一下它的庐山真面目。

试剂盒内一共三个组分,分别是:

组分A、组分B、PC(阳性对照质粒)。

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将各组分取出,在冰上融化。

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二、模板准备


与原核细胞表达不同,这款无细胞试剂盒可以不用质粒模板,只需要在目的基因上下游引入T7转录表达原件,构建一个线性模板。

第一步,用PCR分别获得5UTR片段,3UTR片段以及目的基因片段;

第二步,用重叠PCR方法,将上一步获得的目的基因片段和5UTR片段,3UTR片段拼接称完整的线性表达模板。

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三、体系构建


由于是初次尝试,我这次选择50μL的总体积。在96孔板中反应,按照这张表加试剂和构建好的DNA模板5μL(体系体积的1/10),用移液枪反复吹打混匀。


试剂

阴性对照(μL

阳性对照(μL

实验组(μL

组分A

20.5

20.5

20.5

组分B

16.7

16.7

16.7

DNA模板

/

5

5

双蒸水

12.8

7.8

7.8

反应总体积

50

50

50


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四、孵育


将混合好的反应液转移至摇床中,温度25℃、180rpm,反应16h,确保蛋白表达。


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孵育四小时后,迫不及待先看一下GFP的表达情况,观察到阳性对照已有明显绿色荧光。

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五、收获


次日一早,打开摇床就看到了阳性对照醒目的绿色荧光。既然阳性对照表达了,目标蛋白想来不成问题!满怀期待开始离心、跑胶鉴定。


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六、鉴定


将阴性对照和实验组分别制洗脱样、上清样、沉淀样,上样量:洗脱样、上清样10μL,沉淀样5μL。电泳条件:12%SDS-PAGE胶,100V,1.5h。

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不愧是师兄力荐的“法宝”,没有辜负我的厚望,第一次实验,我的蛋白就在上清中成功表达了!


七、总结

这次实验真是一次全新的体验。在无细胞蛋白表达体系下,整个实验从模板构建、反应体系构建、孵育、到最后收获目标蛋白并鉴定,只用了两天时间,不但在上清中表达出了原核细胞表达中会形成包涵体的蛋白,还大大缩短了实验时间。真让我有把所有蛋白都用无细胞体系表达的冲动!

Tips:


1.无细胞蛋白表达试剂盒可以用线性模板也可以用质粒模板,线性模板更加方便快捷,但是质粒模板表达量一般较高。

2.组分A、B在实验前要提前放在冰上融化,防止试剂失效。使用前先用移液枪吹打混匀,再吸取相应体积。

3.微孔板四周可以加入适量双蒸水,防止孵育过程中体系水分蒸发。本次实验因为要过夜表达,为了确保反应体系不被蒸干,我在96孔板最外侧一周的所有孔位里都加了水,而且在摇床四角也各放置了一只装水的离心管。

4.对于复杂蛋白表达,可以延长孵育时间,保证蛋白充分表达。

5.如果调整反应体积,需要按照说明书推荐随之调整反应容器。


CFPS——蛋白表达“新势力”


初次表达包涵体大获成功,无细胞蛋白表达究竟是“何方神圣”?在实验结束之后,我粗略了解了一下这一新技术,发现它的强大不止于此。

无细胞蛋白表达(Cell-free protein expression,CFPS)是指将细胞内合成蛋白所需要的RNA聚合酶、核糖体及转录翻译辅助因子等分子机器提取出来,并辅以核苷酸、氨基酸、能量物质及基因模板,在没有活细胞参与的体外直接合成蛋白质的生物合成反应。

受细胞自身生理功能限制,有些蛋白在传统的细胞表达系统产量低甚至不能表达,而无细胞系统可以摆脱这种限制,广泛适用于细胞因子、抗体、膜蛋白、毒性蛋白、包涵体蛋白表达等场景。此外,无细胞蛋白表达反应周期短、易与自动化设备结合、自由度与可控程度高,适合蛋白快速交付、酶定向进化筛选、AI蛋白制造、ADC药物开发等领域,可谓是蛋白表达领域的“新势力”。

随着合成生物学发展,无细胞蛋白表达技术已然崭露头角,大有腾飞之势。技术的发展是推动科学研究进步的重要助力,善于利用新技术,有时能使科研过程事半功倍,我也算是深有体会了!



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