技术文章

        一个西班牙医院近期发生Klebsiella pneunomiae细菌的暴发事件，研究人员分离了三个具有耐药性的Klebsiella pneunomiae菌株，并利用罗氏454 GS FLX+系统获得了其基因组序列，这些数据补充了该细菌属的少量已知基因组信息，为其相关的耐药性研究、基因组进化研究提供了新的依据，同时为该细菌在此次医院内爆发事件提供新线索。
        Klebsiella pneunomiae常见于人类口腔以及胃肠道内，大多数情况下并不会引发疾病。但是其基因的某些突变会引起多种类型的感染，同时这一细菌也被发现具有很强的获得耐药性突变的能力。该西班牙医院的微生物部门获得的三个Klebsiella pneunomiae菌株在GS FLX+平台上完成测序后用仪器自带的GS De Novo拼接软件进行基因组拼接，并进行基因功能注释，结果发现这些细菌出现了很多耐药性方面的基因组进化，使得医院内常用的许多抗生素对其失效。
        通过这几个菌株基因组的比较研究，为Klebsiella pneumoniae细菌的抗药性研究提供了大量信息，也为在范围内减少抗药性细菌出现的努力提供帮助。通过与其他细菌基因组的比较，可以进一步了解微生物如何从对人类无害变成具有致病威胁的菌株。
        现在的微生物医学研究正随着测序技术的不断更新发展向新的方向，快速定性、定量研究微生物是目前的一大趋势，而454的GS FLX+以及GS Junior系统为微生物检测、基因组测序拼接、比较基因组研究提供了强大的支持。