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ProtoScript® cDNA 第一链合成试剂盒含两种经优化的混合液:M-MuLV 酶混合液和 M-MuLV 反应混合液。M-MuLV 酶混合液含 M-MuLV 反转录酶和小鼠 RNase 抑制剂,M-MuLV 反应混合液含 dNTP 和经优化的缓冲液。该试剂盒还包含两种优化的反转录引物和无核酸酶水。锚定的 Oligo-dT 引物 [d(T)23VN] 迫使引物与 polyA 尾的起始端退火。经优化的随机引物混合液能随机并持续性地与整个 RNA 模板配对,包括 mRNA 和无 polyA 尾的 RNA。合成的第一链 cDNA 产物长度可超过 10 kb
成功合成 cDNA 的要素:
RNA 模板
高纯度的完整 RNA 对于灵敏的 RT-PCR 检测至关重要。RNA 的 A260/A280 比值应至少 1.7 或更高。
总 RNA 或 mRNA 均可用于反转录反应。总 RNA 通常足以进行大多数 RT-PCR 分析。不过,如果需要,可以使用 PolyA Spin mRNA 分离试剂盒(NEB #S1560)或 mRNA 磁性分离试剂盒(NEB #S1550)获得 mRNA。
检测所需的 RNA 量取决于目标转录本的丰度。通常推荐使用 1 ng 至 1 μg 的总 RNA 或 0.1-100 ng 的 mRNA。
cDNA 第一链合成反应
RNA 和引物在 70℃ 条件下变性 5 分钟,可以去除阻碍较长 cDNA 合成的二级结构。不过,可以在某些情况下省略此步骤(结果未发表)。
推荐在 42℃ 条件下温育一小时,以获得最高产量和最大长度。不过,许多靶标用较短的温育时间即可进行检测。例如,对于 2 kb cDNA 合成,温育 5 分钟就足够了。
选择反转录引物
Oligo d(T) 引物是大多数实验的首·选,因为它确保所有 cDNA 拷贝在 mRNA 的 3´ 端终止并产生最长的连续 cDNA。锚定的 Oligo-dT 引物 [d(T)23VN] 迫使引物与 polyA 尾的起始端退火,从而防止在 polyA 尾的内部位点开始退火(1)。不过,如果需要,也可以选择另外两种引物。
随机引物混合液是经优化的六聚体和 d(T)23VN 引物混合液。该混合液能随机地与整个 RNA 模板配对,包括 mRNA 和无 polyA 尾的 RNA(例如核糖体 RNA)。随机引物混合液产生的 cDNA 平均长度较短,可用于检测多个短 RT-PCR 产物。随机引物混合液在各种 RNA 模板中均具有良好的性能。
基因特异引物用于 cDNA 合成反应时,cDNA 产物只能用于扩增该转录本。RNA 起始量较低(低于 10 ng)且只需要一种特定的 cDNA 时,使用这种方法可以获得良好的结果。
推荐的引物浓度:
引物:终浓度
OLIGO d(T)23VN:5 μM
随机引物混合液:6 μM
特异引物:0.1–1 μM
NEB E6300S cDNA第一链合成试剂盒 cDNA合成
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产品应用:
ProtoScript® First Strand cDNA Synthesis Kit 适用于以下应用领域:
定量RT-PCR (qRT-PCR): 利用高保真cDNA合成结果进行定量基因表达分析。
基因克隆: 在克隆实验中用作RT-PCR的cDNA模板,确保高保真度。
基因组学研究: 用于复杂基因组和转录组分析,生成高质量的cDNA片段。
病毒学研究: 适用于病毒RNA逆转录,生成高质量cDNA供后续分析。
华雅思创生物提供New England BioLabs (NEB)全系列产品:包括限制性内切酶,PCR、qPCR和扩增试剂,DNA修饰酶,NGS和目标浓缩的样品制备,核酸提纯,RNA试剂,DNA组装、克隆和诱变试剂盒,基因组编辑试剂,细胞分析,表观遗传学,蛋白质表达与纯化技术,感受态细胞,蛋白质工具,糖生物学,DNA质粒,缓冲液,菌株。