XRM技术在生命科学领域中有着非常广泛的应用，高分辨断层三维扫描主要可以应用于骨科学、口腔科学、植物学以及医学领域中的呼吸系统研究、血管系统研究以及生物制药研究等方面。这其中，骨科学是早引入XRM技术的，且目前的应用情况为成熟。

实例

 大鼠骨小梁局部壁厚分布三维表征，Bruker Skyscan1276

骨活检，机械载荷，Bruker Skyscan1275

羊骨，钛植入物三维形貌表征，Bruker Skyscan 1275

小鼠胫骨壁厚分布三维体渲染图，Bruker Skyscan 1272

雌性石蜂三维体渲染图，（a）背部；（b）腹部 Bruker Skyscan 1272

尼安德特人头骨三维体渲染图，Bruker Skyscan1273

牙本质小管多尺度三维分析，Bruker Skyscan 2214