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半乳糖氧化酶/Galactose oxidase
1. DNA带模糊
1) DNA降解:避免核酸酶污染;
2) 电泳缓冲液陈旧:电泳缓冲液多次使用后,离子强度降低,pH值上升,缓冲能力减弱,从而影响电泳效果。建议经常更换电泳缓冲液;
3) 所用电泳条件不合适:电泳时电压不应超过20V/cm,温度<30℃;巨大DNA链电泳,温度应<15℃;核查所用电泳缓冲液是否有足够的缓冲能力;
4) DNA上样量过多:减少凝胶中DNA上样量;
5) DNA样含盐过高:电泳前通过乙醇沉淀去除过多的盐;
6) 半乳糖氧化酶/Galactose oxidase有蛋白污染:电泳前酚抽提去除蛋白;
7) DNA变性:电泳前勿加热,用20mM NaCl缓冲液稀释DNA。
2. 不规则DNA带迁移
1) 对于λ/Hind III片段cos位点复性电泳前于65℃加热DNA 5分钟,然后在冰上冷却5分钟;
2) 电泳条件不合适:电泳电压不超过20V/cm;温度<30℃;经常更换电泳缓冲液;
3) DNA变性:以20 mM NaCl Buffer稀释DNA,电泳前勿加热。
3. 带弱或无DNA带
1) DNA的上样量不够:半乳糖氧化酶增加DNA的上样量;聚丙烯酰胺凝胶电泳比琼脂糖电泳灵敏度稍高,上样量可适当降低;
2) DNA降解:避免DNA的核酸酶污染;
3) DNA走出凝胶:缩短电泳时间,;
4) 对于EB染色的DNA,所用光源不合适:应用短波长(254nm)的紫外光源。
4. DNA带缺失
1) 小DNA带走出凝胶:缩短电泳时间,;
2) 分子大小相近的DNA带不易分辨:增加电泳时间,核准正确的凝胶浓度;
3) DNA 变性:电泳前请勿高温加热DNA链,以20 mMNaCl Buffer稀释DNA;
4) DNA链巨大,常规凝胶电泳不合适:在脉冲凝胶电泳上分析。
5. DNA电泳的Marker怎么是扭曲的?
1)半乳糖氧化酶(Galactose Oxidase)配制胶时的缓冲液需要和电泳缓冲液不是同时配制的。*是同时配制.电泳时缓冲液高过液面1-2mm即可。
2)电泳时电压过高,可以在电泳前15分钟用较低电压(3V/cm),等条带出孔后比较整齐了,再调高电压。
3)上样时尽量慢慢加样,等样品自然沉降后再加电压。