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GFP-Nanoab-Magnetic Beads
货号:GNM-25-1000/GNM-50-2000
储存条件:可在 4℃保存半年,避免离心,干燥,长时间保存可冻存。
产品描述
偶联 anti-GFP 纳米抗体的磁性纳米微球用于免疫沉淀 GFP 融合蛋白。
产品优势
没有普通抗体的轻链和重链;
高亲和力:解离常数达到 pM 级别;
高载量:20μl 的 slurry 可以结合 8-10μg GFP 蛋白;
较短的孵育时间,结合 5-30 min 即可;
应用范围
可用于免疫沉淀(IP)/免疫共沉淀(CoIP)、染色质免疫沉淀(ChIP)/RNA 结合蛋白免疫沉淀(RIP)、酶活性测定、质谱分析等;
特异性
可以结合 GFP、EGFP、YFP 和 EYFP 等。
产品特性
保存条件:可在 4℃保存半年,避免离心,干燥,长时间保存可冻存。
存储缓冲液:PBS(含有 20%乙醇)。
实验步骤:
收集细胞:
每个免疫沉淀反应大约使用 106-107 的哺乳动物细胞(约一个 10 cm培养皿)表达绿色荧光蛋白融合蛋白。吸出生长培养基、向培养皿中加入 2ml预冷的 PBS 洗涤细胞 2 次,利用细胞刮或yi酶消化的方法收集贴壁细胞,细胞转移到离心管,500 g离心 3 分钟并丢弃上清液。
植物组织裂解处理:
取适量植物组织样本(叶片等)放置于冷冻液氮中,之后将冷冻后得植物组织样本放于研钵进行研磨,尽 可能充分研磨破坏其细胞壁。加入 500-1000ul RIPA 裂解液(已加蛋白酶抑制剂 PMSF 等)进行裂解,为了提高裂解效率,加入 200ul 玻璃粉充分震荡 30min,裂解完成后 12000 rpm,离心 30min,吸取上清 置新的离心管中,弃去沉淀。
细胞裂解:
1.用500μl 预冷的裂解缓冲液重悬细胞,在裂解缓冲液中加入蛋白酶抑制剂与 1 mM PMSF(自备)。对于核/染色质蛋白可使用 RIPA 裂解液中加入1 mg/ml DNase, 2.5 mM MgCl2,蛋白酶抑制剂与 1 mM PMSF(自备)。
2.把离心管放置在冰上 30 分钟,可以每 10 分钟充分吹打一次。
3.细胞裂解产物在 4℃,20,000 g 条件下离心 15 分钟,转移裂解产物到一个新的预冷管中,丢弃沉淀。注意:此时细胞裂解产物可以放在-80℃进行长期储存。
平衡珠子:
4.振荡混匀 GFP-Nanoab-Magnetic Beads,吸取 40μl slurry 到 500 μl 预冷的裂解缓冲液中,在磁力架上分离磁珠直到上清变成清亮的状态,丢弃上清液。(此步骤可选)
结合蛋白
5.将细胞裂解产物加入到平衡的 GFP-Nanoab-Magnetic Beads 中(如果未做第 4 步,可在细胞裂解产物中直接加入40μl slurry),在 4 ℃冷柜中的旋转混合仪上结合 30-60 min。如果需要,保存 50 μl 的裂解产物进行免疫印迹分析。
6. 在磁力架上分离磁珠直到上清变成清亮的状态,丢弃上清液。如果需要,保存 50 μl 上清液进行免疫印迹分析。
清洗珠子:
7. 用 500 μl 预冷的裂解缓冲液中重悬 GFP-Nanoab-Magnetic Beads,在磁力架上分离磁珠直到上清变成清亮的状态,丢弃上清液并重复洗涤 2 次。(可选:在第二次洗涤的步骤中增加盐浓度到 500 mM)。
洗脱蛋白:
方法一:
加入 20μl 2X SDS-sample buffer 重悬 GFP-Nanoab-Magnetic Beads。
在 95℃,10 min 条件下,加热 GFP-Nanoab-Magnetic Beads,把免疫沉淀复合物从珠子上游离出来。GFP-Nanoab-Magnetic Beads 可在磁力架上进行分离,收集的产物可以进行 SDS–PAGE 分析。
方法二:
替代步骤 8 和 9 的可选步骤:加入 50μl 0.2 M pH2.5 的甘an酸洗脱结合的蛋白,建议孵育时间 30 秒,并不断混匀,随后用磁力架进行分离,转移上清液到新管中,为了中和酸性的甘an酸,需添加 5μl 1.0 M Tris(pH10.4)。注意:为了提高洗脱效率可以重复这一步。
可选方案
方案一:
如需进行 GFP 融合酶的活性检测,无需洗脱,可以直接检测。
方案二:
如需进行染色质免疫沉淀(ChIP) 实验,主要用于含有 GFP 融合蛋白的蛋白质/DNA 相互作用的实验。染色质免疫沉淀一般包括细胞固定,染色质断裂,染色质免疫沉淀,交联反应的逆转,DNA 的纯化以及 DNA 的鉴定。其中前期细胞固定,染色质断裂不变;然后接着直接进入说明书的第 5 步,加入细胞裂解产物后,DNA-蛋白质复合物结合到 GFP-Nanoab-Magnetic Beads上;进入第 6 和 7 步,分离得到复合物;进入第 10 步,得到洗脱的复合物;后期交联反应的逆转,DNA 的纯化及 DNA 的鉴定等同于普通的 ChIP 实验。RNA 结合蛋白免疫沉淀(RIP)实验步骤同上。
方案三:
GFP-Nanoab-Magnetic Beads 不仅可以用于在体内外检测和验证蛋白质之间的相互作用,也可以结合质谱分析筛选与已知蛋白相互作用的未知蛋白。其操作步骤同免疫沉淀法,得到洗脱的复合物后,然后进行 SDS–PAGE 分析,用考马斯亮蓝或者银染的方法染色后,切下未知蛋白的条带,用质谱技术鉴定未知蛋白。