快速动力学停流的工作原理就是样品快速混合单元将各反应物在气动装置的作用下快速推进，经喷嘴在短时间内*混合后，流入反应观察池，并突然停止流动，通过测定溶液的某一特性（如吸光度、电导等）随时间的变化来监测反应进程。对于停流光谱仪中发生的臭氧-有机污染物液相均相反应，可简单表示为：aA+B→pP，其中A、B、P分别代表有机臭氧、污染物和氧化产物，a与p为反应计量系数。
快速动力学停流分析的一个优点是快速：
尽管有的化学反应很慢，甚至反应的半寿期长达几个小时，但用停流法可测定反应开始几秒钟内的反应速度，从而迅速的测出待分析物的浓度。而基于同一反应的平衡方法，则要等反应达平衡后才能测定，相比之下就慢得多。特别是停流法与计算机或微处理机结合，可以自动地进行样品的配制、样品和试剂的取样及混合、数据的捕获及处理。这不仅解除了繁杂的人工操作，而且既快速，重复性又好，大大加快了分析速度，提高了分析精度。
如用自动停流法测定磷酸盐和Mo（V）在强酸介质中生成12-钼磷酸的初始速度，检测磷酸盐的浓度，测量时间只用0.3秒，而整个样品的分析时间也仅为0.7秒，这样每小时能分析几千个样品，相对标准误差在2-3%的范围内。同一样品的多次重复测量，可使其相对标准误差降至1%以下。该方法还被实际用来测定血液中磷的含量，所用的样品少，0.2ml的血液样品足以进行约100次的测定，多次测定的平均值可使测量的精度在0.5-3%范围内。
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