RNaseA和DNase I ，核酸提取好伴侣

RNaseA，即核糖核酸酶A，是一种内切核酸酶，能够特异性地降解RNA分子。它能够在嘧啶残基的3’末端切割单链RNA，形成具有3’-末端嘧啶-3’-磷酸酯的寡核糖核苷酸。通过RNaseA的切割作用，相邻的嘧啶核苷酸会被释放，从而实现RNA分子的降解。

在DNA和质粒提取过程中，RNAseA起到了至关重要的作用。由于一些实验和应用中需要获得纯净的DNA样本或质粒样本，而RNA的存在可能会干扰后续实验的结果，因此，在提取DNA时，通常会添加RNaseA来降解样品中的RNA分子。

RNaseA对DNA分子并不具有降解作用。DNA分子具有稳定的双链结构，不容易被酶降解。因此，在使用RNaseA时，可以确保DNA分子的完整性和浓度不受影响。这一特性使得RNaseA成为DNA提取过程中的工具。

在使用RNaseA时，也需要注意酶的浓度和反应时间。过高的酶浓度或过长的反应时间可能会导致DNA分子也被部分降解，从而影响提取得到的DNA的完整性和浓度。因此，在使用RNaseA时，需要根据具体实验目的和样品特性进行优化，以确保得到高质量的纯净DNA样本。

在使用RNaseA时，需要注意对RNA相关实验的污染，做RNA相关实验时，需要使用Surface RNase Remover (with Spray Bottle) 固相RNase清除剂（含喷雾瓶）（10609ES）清除RNase，从而创造洁净的RNA工作环境。

DNase I，即Deoxyribonuclease I，中文名称为脱氧核糖核酸酶I，是一种可以消化单链或双链DNA产生单脱氧核苷酸或单链或双链的寡脱氧核苷酸的核酸内切酶。DNase I水解单链或双链DNA后的产物，5'端为磷酸基团，3'端为羟基。虽然DNase I裂解通常被认为是非特异性裂解，但DNase I更有可能作用于某些序列片段，如小沟区，并且更容易发生嘌呤-嘧啶序列的裂解。然而，当DNase I作用于异质dsDNA时，所有四个碱基都将被切开，对特定碱基的影响不会超过其他碱基的3倍。

1、核酸提取中制备不含DNA的RNA样品：

在RNA提取过程中，DNase I可用于消化掉提取核酸中所残留的DNA成分，从而得到高纯度的RNA产物。这对于后续如mRNA表达量分析、转录组分析等实验至关重要。

2、RT-PCR反应前去除DNA污染：

在进行RT-PCR反应前，RNA样品中可能存在的基因组DNA等DNA污染会影响实验结果。DNase I可以有效地去除这些DNA污染，确保RT-PCR反应的准确性。

3、体外转录后去除DNA模板：

在体外转录实验中，如使用T7、T3、SP6等RNA聚合酶进行RNA合成时，合成后的RNA可能会有DNA残留。DNase I可用于去除这些模板DNA残留，特别是在mRNA疫苗生产制作等需要高纯度RNA的场合。

4、DNase I足迹实验：

DNase I足迹实验（DNase I footprinting）是一种研究DNA-蛋白质相互作用的方法。通过DNase I对DNA的切割作用，可以揭示出与蛋白质结合的DNA区域，从而了解DNA与蛋白质之间的相互作用关系。