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    酶标抗体仅需适当底物和普通光学显微镜即可高度敏感地检出抗原。由于信号是通过吸收光的差异，而非发射光来检测，底物的不溶性显色产物分布在酶所在位置的周围区域，因此这种检测方法尚不能达到荧光技术的分辨率。

    酶反应后出现沉淀，在酶所处位置周围产生不溶性显色产物，通过底物的显色来检出酶标试剂所处位置。多种酶及底物可供选择，但近年来多选用辣根过氧化物酶(HRP)及底物二氨基联苯胺(DAB)来进行培养细胞的染色。HRP可与抗Ig抗体、蛋白A、蛋白G、亲和素或链霉亲和素等共价偶联，其中任何一种二级试剂均可用于检测与目标抗原结合的一抗的位置。

        细胞染色法如果实验要求操作简单，用同一条件观察大量样品，用酶联检测法较好；如实验要求高分辨率，则应用荧光素标记检测法；共聚焦显微镜比相差显微镜具有更高的分辨率。如考虑敏感性，选用共聚焦显微镜法，再依次为酶联法及荧光显微镜法。如考虑到价格因素，则酶联法为。