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APOBEC-coupled epigenetic sequencing （ACE-Seq）
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深圳市易基因科技有限公司(简称易基因，E-GENE Co.,Ltd.)专注表观组学十余年，以“表观遗传学科学研究与临床应用”为愿景，依托高通量测序技术和云数据分析平台。为医疗机构、科研机构、企事业单位等提供以表观遗传学技术为核心的多组学科研服务及解决方案，全面覆盖针对生命科学基础研究、医学及临床应用研究等内容。
易基因专注表观组学十余年，多组学科研服务。技术团队在国际上LHC-BS、HMST-seq、ChIP-BS、cfDNA-TBS等甲基化、羟甲基化技术流程，研发建立简化基因组甲基化dRRBS、cfDNA-RBS，单细胞/微量DNA全基因组甲基化及简化高通量甲基化测序技术，RNA甲基化测序等技术和方法，并建立易基因科技全自动化弹性资源生信分析系统。在Nature、Lancet、Science、Nat Commun、 Cell Res、Genome Biol、Blood、PloS Genet、Epigenetics、Epigenomics 、Clin Epigenetic等期刊发表论文100余篇，申请发明12项、软件著作权27项。
T：0755 - 28317900
V：181 2416 7839
详细信息
该技术是一种鉴定5hmC的方法。DNA脱氨酶APOBEC3A(A3A)能够特异地脱去C及5mC的氨基使其变为U，而5hmC则因为不被该酶识别，测序时仍被识别为C。该技术利用该酶的这种特性，特异性地检测基因组上发生的5hmC修饰。ACE-seq原理示意如下：
（1）利用β-葡糖基转移酶（βGT）将5hmC加上葡糖基，转变成5ghmC，5ghmC不会被A3A酶脱氨基。
（2）利用A3A酶特异去除C和5mC的氨基，使其转变成U，而5hmC保持为C，从而将5hmC和C/5mC区分开来。
技术优势：
1、检测范围为全基因组；
2、单碱基分辨率；
3、起始DNA量比常规的oxBS技术降低100倍；
4、高准确性。
信息分析：
技术参数：
研究案例：
开发了ACE-Seq技术并利用ACE-Seq探究小鼠脑部神经细胞5mC及5hmC的特征及作用
Nondestructive, base-resolution sequencing of 5-hydroxymethylcytosine using a DNA deaminase
1、背景：
传统的鉴定5hmC的技术需要运用化学试剂进行转化，会破坏基因组DNA，且需要的DNA起始量较大。建立一种非破坏性的、低起始DNA量的鉴定5hmC的技术有助于加快加深5hmC的研究。
2、方法：
利用DNA脱氨酶APOBEC3A(A3A)特异性脱去C及5mC的氨基使其转变成U的特性，建立了一种新型的鉴定基因组上的5hmC修饰的技术，并将该技术结合BS-Seq技术，研究了小鼠脑部神经细胞5mC及5hmC的特征及作用。
3、结论：
分析了小鼠脑部神经细胞5mC及5hmC在不同基因元件的水平；
探究了小鼠脑部神经细胞5mC及5hmC的异质性。
探究了5mC及5hmC在小鼠脑部神经细胞中的作用。
