BE3柱式厌氧反应器的特点是一个细长的圆柱形玻璃柱，分为两部分，每部分带有加热套。在圆柱顶部，第三个未加热部分收集气体并供污水流出。在两个加热段之间是一个歧管，为仪表、取样和加药提供端口。反应器的进料由变速蠕动泵提供。

通过使温水通过下部两段的夹套循环，可以控制柱内物体的温度。水在加热箱中使用电加热器加热，使用PID控制，通过再循环泵分配。通常，反应器温度设置为35°C，以适应原料中的厌氧菌。

柱内物体可使用变速泵从顶部循环至底部。再循环还可用于使支持生物质生长的介质床（如浮石）流态化。或者，圆柱可以作为无介质填充的膨胀颗粒污泥床反应器（EGSB）运行。

新型厌氧反应器的一个新特点是气体收集系统。能够在较长时间内准确测量气体排放率。即使在产生极少量气体的情况下，可以测量，同时在系统中保持较低的背压，以免抑制气体的释放。工作原理是在水上收集已知体积的气体。当收集罐装满时，气体会自动排出并更换水。PLC计算循环次数以测量气体总体积，并测量排放之间的时间以计算流量。

反应器配有一个pH加药系统，包括PLC控制下的两个蠕动泵，用于向反应器添加碱性溶液或酸性溶液（视情况而定）。用户可以自定义要保持的pH值范围。

为标准的5升化学品罐提供了储存位置，使配料溶液能够提前制备并在整个过程中保持在原位，从而将处理潜在有害化学品的需要降至。

除气体收集速率和体积外，进一步测量反应器温度、pH值、水温和再循环流量。

数据都可以使用数据记录器记录在电脑上上