质谱成像技术就是借助于质谱的方法，再配套上专门的质谱成像软件控制下，使用一台通过测定质荷比来分析生物分子的标准分子量的质谱仪来成像的方法。早的质谱成像技术是基质辅助激光解吸电离(MALDI，matrix assisted laser desorption ionization)质谱分子成像技术，由范德堡大学(VanderbiltUniversity)的Richard Caprioli等在1997年提出。 

通过将MALDI质谱离子扫描技术与专业图像处理软件结合，直接分析生物组织切片，产生任意质荷比(m/z)化合物的二维离子密度图，对组织中化合物的组成、相对丰度及分布情况进行高通量、全面、快速的分析，可通过所获得的潜在的生物标志物的空间分布以及目标组织中候选药物的分布信息，来进行生物标志物的发现和化合物的监控。

质谱仪成像技术（MSI）可用于分析细胞的代谢物和多肽的含量和分布，研究细胞的状态和周围环境对其的影响，以及正常细胞与疾病细胞间的差异。

质谱仪成像技术（MSI）不需要探针、放射性同位素标记、荧光标记、化学发光物标记和染色标记；不局限于一种或者几种特异的蛋白质行或代谢物分子。可在事先不了解所检测的蛋白质或代谢物信息的情况下，在切片组织中找到每一种蛋白质或代谢物分子并提供这些分子在组织中的空间分布的精确信息。

质谱仪成像技术（MSI）还可划分肿瘤组织与周围正常组织的界限，可以补充染色得到的组织学信息。

生物分子质谱成像（MSI）技术可以全面、快速、高通量的进行生物标志物的发现，协助评价生物标志物、组织病理特征和疾病诊断研究，终为药物疗效和开发提供技术支撑。目前研究涉及的疾病包括胰腺癌、卵巢癌、乳腺癌、帕金森病、非小细胞肺癌、阿尔茨海默氏症、法布里病、肌肉萎缩症、狂犬病、肾脏疾病、肝癌、非酒精性脂肪肝、心血管疾病、神经胶质瘤、霍奇金淋巴瘤、胃肠道的癌前病变和神经节苷脂沉积病等。

MEDING等利用质谱成像技术成功将六种常见的癌症探测出来，包括食管癌、乳腺癌、结肠癌、肝细胞癌、胃癌和甲状腺癌。研究者们利用生物分子质谱成像（MSI）技术建立各种已知癌症类型的不同蛋白分子标志物的数据库，根据其蛋白质组学的差异性，将癌症细胞特定的图谱提取出来并进行分类，获得了很高的可信性。

应用：肝脏组织切片---从分子水平了解不同组织上的差异信号

质谱成像是以质谱技术为基础的成像方法，该方法通过质谱直接扫描生物样品成像，可以在同一张组织切片或组织芯片上同时分析数百种分子的空间分布特征。简单而言，质谱成像技术就是借助于质谱的方法，再配套上专门的质谱成像软件控制下，使用一台通过测定质荷比来分析生物分子的标准分子量的质谱仪来成像的方法。