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LabpO TOPO-TA/Blunt通用克隆试剂盒
产品货号:PT0101
储存温度:-20℃储存,至少12个月。冰袋运输,1-2 天置于室外常温不影响质量。
试剂盒组成 | 20次 | 80次 |
TOPO-TA/Blunt Vector(30ng/ul) | 40ul | 160ul |
1000bp Control(30ng/ul) | 5ul | 5ul |
10 Enhancer | 20ul | 80ul |
产品介绍
本制品和传统的T4连接酶原理不同,它利用了Topoisomerase可以在瞬间(几秒钟-几min)、高效(接近100%)连接DNA片段的原理采用本公司du创的工艺制成。
(1)可以在瞬间(几秒钟-几min)完成任意PCR产物(兼容A末端/平末端)连接。
(2)特制的新型载体质粒大小仅仅不到2kb,充分发挥了TOPO载体越小,可容纳片段越大的优势,最大限度提高了大片段连接效率;连接后质粒大小比传统载体小2kb以上,质粒越小,转化效率越高,极大的提高了各种片段连接后的转化子数量。
(3)采用氨苄抗性载体只需10min复苏时间,比卡那抗性载体1小时复苏时间缩短6倍。
(4)最快可以不用冰浴和热休克,室温5min内完成转化;无需1小时复苏,只需37℃10 min复苏便可以涂板。从连接到涂板最快只需15-20min。
(5)zi杀基因零背景原理,无自连假阳性,无需繁琐蓝白斑筛选和菌落PCR筛选。大部分情况下随机挑一个克隆便是有插入的(接近100%)。
(6)连接长片段能力远超传统TA/Blunt克隆载体,可连接长达10kb片段(例如连接5kb片段,也可能达到挑10个菌落,至少8个是有插入的效果),是新一代shi界领xian的简单、快速、零背景免筛选的TOPO TA/Blunt克隆载体。
注意:测序只能采用M13F/M13R通用引物测序(见后面图谱),但是不能采用M13(-47)/M13(-48)通用引物测序。菌落 PCR 可使用和测序相同的引物。
操作步骤
1.连接反应的准备:
PCR引物使用正常设计的引物即可,不需做任何改变(不能用磷酸化引物)。任意PCR产物(兼容A末端/平末端)均可以直接连接。PCR产物一般建议胶回收纯化,这样可以避免后续可能的问题。如果PCR产物仅有目的条带、无非特异条带和引物二聚体,也可尝试直接进行连接反应。如果是以质粒为模板的PCR产物则最好进行纯化,因为模板质粒也可能长出菌落(但不是想构建的目的载体)。
2.连接反应:
1)室温(25℃-37℃)设立10ul连接体系(建议用0.2ml PCR 管,PCR仪器控温):
纯化后的PCR产物或1ul 1000bp control | 0.5-5ul |
TOPO-TA/Blunt Vector | 2ul |
10 x Enhancer | 1ul |
无菌水 | Xul |
总体积 | 10ul |
加完试剂后,用移液器轻轻吹打混匀或者轻弹管底混匀,低速瞬时离心收集所有液体在离心管底,注意此步骤不能在冰上进行,只能在室温(25℃-37℃)进行。
注:如果使用5ul体系连接,各成分按照比例减半使用,使用次数可以加倍。不同大小插入片段的推荐用量(注意过量太多了,反而导致转化子减少)
插入片段大小(bp) | 推荐用量(ng) |
100-1000 | 10-40 |
1000-2000 | 40-80 |
2000-5000 | 80-180 |
2)室温(25℃-37℃)连接5min。
本载体推荐室温(25℃-37℃)5min完成连接。长片段或者连接困难片段可以延长连接时间到10-15min,温度可选37℃,可显著增加转化子数量。
3)连接产物置于冰上备用。立即接标准的感受态转化步骤或者快速转化步骤。
3.快速转化:
1)感受态细胞从-80℃拿出,迅速插入冰浴中,解冻融化(约1-3min左右)。
2)立刻加入5ul连接液(最多可全部加入,只要体积不超过感受态细胞体积的1/10), 用手拨da离心管底轻轻混匀(避免用枪吸打),冰浴放置5min。
3)42℃水浴热激60秒,迅速放回冰浴静置2-3min,该过程不要摇动离心管。
注意:此步骤shou选建议 42℃水浴 60 秒热激。但是根据我们的经验,大部分商品化的TOP 10 和 DH5a 感受态细胞此步骤也可将离心管置于室温(˃22℃)进行, 时间不需十分准确,夏季或室温较高时,可放置 5-8min左右;如果室温较低,可延长时间至8-15min左右。有经验的客户可以根据具体情况尝试无热激转化。
4)加 300-500ul LB或者SOC培养基(不含抗生素),37℃ 200 rpm 振荡培养10min。
根据经验,一般可以直接将培养基(如从冰箱取出温度低,应事先置37℃温箱回温至22℃-37℃)加入到感受态细胞的1.5 ml 离心管,盖上离心管盖,水平固定在振荡培养箱中振荡培养复苏即可,不需要转移到试管培养复苏。
一般商品化的感受态细胞不超过 2kb 插入片段情况下,热休克后 10-15 min复苏可以得到足够多转化子,如果使用实验室自制的感受态效率低、或者转化子少、插入片段长的情况下可以提高复苏时间到 30-60 min以得到更多的转化子。
5)取100-200ul菌液涂板(培养板含氨苄qing霉素100ug/ml),培养过夜。(如果预计转化子少,为得到较多克隆,4000rpm 离心1min,吸弃掉部分上清,保留100-150ul,轻弹悬浮菌体,取全部菌液涂板)
4.转化子的筛选鉴定:
本制品采用zi杀基因零背景原理,无插入自连的细菌会zi杀无法生长,因此几乎没有假阳性,一般情况下,可以达到所见即所得,只要是长出来的菌落正常(不是污染的杂菌,转化子数量也不算太少),基本就包含插入。因此插入片段不超过 2-3kb 的情况下可以不用菌落PCR 鉴定,直接挑 1-2 个菌去测序。
1)一般本公司TOPO 载体阳性率非常高,所以菌落生长正常,数量也不是太少的情况下建议省略菌落 PCR/菌液 PCR 鉴定直接去测序。注意测序引物不能采用M13(-47)/M13(-48)通用引物测序。
2) TOPO 载体的菌落 PCR 结果容易出现假阴性。因此在使用菌落 PCR 鉴定的情况下,如菌落 PCR 结果阳性,一般可以相信此结果。如结果是阴性,或者显示扩增出大小和预期不符合,一般不可相信,要考虑到菌落 PCR 结果假阴性的可能。需要进一步提取质粒电泳跑大小,或者酶切鉴定来确认。
用上述培养的白色菌落的菌液抽提质粒,插入片段较大的情况下,直接跑电泳看质粒大小就直接能鉴定出有插入的质粒,还可用 EcoR I/Ecor V 单酶切释放插入片段或用其它合适的酶切,琼脂糖凝胶电泳检查片段大小,确定是否含有目的片段。
pTOPO-TA/Blunt 载体图谱:
pTOPO-TA/Blunt 载体多克隆位点序列: