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蛋白组学技术服务之免疫沉淀实验免疫沉淀(Immunoprecipitation,IP)是一种基于抗原和抗体特异性相互作用的实验技术,用于研究蛋白质之间的相互作用以及蛋白质与其他生物分子之间的关系。
这一技术通过特异性抗体捕获目标蛋白,并通过与Protein A/G琼脂糖珠的结合,使目标蛋白及其复合物从细胞裂解液中沉淀出来,从而实现对感兴趣蛋白的研究。
下面将详细阐述免疫沉淀实验的流程、应用及注意事项:
1. 免疫沉淀基本流程
细胞裂解:首先收集细胞并加入适量的细胞裂解缓冲液(含蛋白酶抑制剂),在冰上或4℃条件下裂解30分钟,然后以12,000g离心30分钟取上清。
抗体孵育:取少量裂解液备用(作为Input样品),在剩余裂解液中加入特定抗体和Protein A/G琼脂糖珠,然后在4℃条件下缓慢摇晃孵育过夜。
清洗洗脱:通过离心收集免疫沉淀物,并用裂解缓冲液洗涤数次以去除非特异性结合蛋白,最后加入SDS上样缓冲液,沸水煮后进行SDS-PAGE电泳和Western Blot
分析。
2. 免疫沉淀应用领域
蛋白质相互作用分析:通过免疫沉淀捕获目标蛋白,再用Western Blot检测是否存在与之相互作用的其他蛋白。
鉴定未知蛋白:利用质谱技术对免疫沉淀后的样品进行分析,可以发现新的与目标蛋白相互作用的未知蛋白。
研究蛋白修饰:免疫沉淀可以用于富集具有特定修饰(如磷酸化)的蛋白亚型,进而研究其功能和调控机制。
3. 免疫沉淀优缺点
优点:能够反映生理条件下的蛋白质间相互作用,适用于多种蛋白复合物的分离和分析;可以与各种检测方法如质谱、Western Blot联用,提高研究的深度和广度。
缺点:可能无法捕捉到低亲和力和瞬时的蛋白互作;非特异性吸附可能导致假阳性结果,必须通过严格的实验设计和对照来排除。
4. 免疫沉淀注意事项
优化裂解条件:选择合适的裂解液成分(如离子强度、去垢剂种类和浓度)对于保持蛋白复合结构的完整性至关重要。
抗体选择:确保抗体的高特异性和适用性,使用合适的IgG作为阴性对照。
洗涤步骤:通过多次洗涤琼脂糖珠,尽量去除非特异性吸附的蛋白。
综上所述,蛋白组学技术服务之免疫沉淀实验是一项强大的实验技术,通过特异性抗体捕获和沉淀目标蛋白及其复合物,研究者能够深入探讨蛋白质间的相互
作用及其在细胞内的功能。通过严谨的实验设计和操作,可以尽可能地减少假阳性结果,确保实验数据的可靠性。免疫沉淀不仅有助于阐明蛋白相互作用网络,还
能为疾病机理和新药靶点的发现提供重要线索。