苏mu精为碱性天然染料，可使细胞核着色。细胞核内染色质的成分主要是DNA，在DNA的双螺旋结构中，两条核苷酸链上的磷酸基向外，使DNA双螺旋的外侧带负电荷，呈酸性，很容易与带正电荷的苏mu精碱性燃料以离子键或氢键结合而被染色。苏mu精在碱性溶液中呈蓝色，所以细胞核被染成蓝色。

HE染色实验分化作用

染色后，用某些特定的溶液将组织过多结合的染色剂脱去，这个过程称为分化作用，所用的溶液称为分化液。在HE染色中用0.5%盐酸乙醇作为分化液，因酸能破坏苏mu精的醌型结构，使组织与色素分离而褪色。经苏mu精染色后，必须用0.5%盐酸乙醇分化，使细胞核过多结合的苏mu精染料和细胞浆吸附的苏mu精染料脱去，在进行伊红染色，才能保证细胞核与细胞浆染色的分明。因此，在HE染色中分化是极为关键的一步。

HE染色实验返蓝作用

分化之后，苏mu精在酸性条件下处于红色离子状态，呈红色，在碱性条件下处于蓝色离子状态，呈蓝色。组织切片经0.5%盐酸乙醇分化后呈红色或粉红色，故分化之后，立即用水出去组织切片上的酸而终止分化，再用弱碱性水（0.2%氨shui）使苏mu精染上的细胞核呈现蓝色，这个过程称为返蓝作用或蓝化作用。