自动聚焦显微镜主要用于观察什么？自动聚焦显微镜可对金属、陶瓷、岩石等材料以及各种固体材料的微观形貌观察和微区元素成分、线分布、面分布等分析纳米技术、材料、物理、化学、环境科学等领域。除了实验室里的各种微小的样品，其实自动聚焦显微镜也可以在很多地方用到。
1、测绘工程领域：大坝和电站基础地形测量、公路测绘，铁路测绘，河道测绘，桥梁、建筑物地基等测绘、隧道的检测及变形监测、大坝的变形监测、隧道地下工程结构、测量矿山及体积计算，显微镜都可以用到。
2、结构测量方面：桥梁改扩建工程、桥梁结构测量、结构检测、监测、几何尺寸测量、空间位置冲突测量、空间面积、体积测量、三维高保真建模、海上平台、测量造船厂、电厂、化工厂等大型工业企业内部设备的测量；管道、线路测量、各类机械制造安装。
3、建筑、古迹测量方面：建筑物内部及外观的测量保真、古迹古建筑、雕像等、的保护测量、文物修复，古建筑测量、资料保存等古迹保护，遗址测绘，赝品成像，现场虚拟模型，现场保护性影像记录。
4、紧急服务业：陆地侦察和攻击测绘，监视，移动侦察，灾害估计，交通事故正射图，森林火灾监控，滑坡泥石流预警，灾害预警和现场监测，核泄露监测。
5、娱乐业：用于电影产品的设计，为电影演员和场景进行的设计，3D游戏的开发，虚拟博物馆，虚拟旅游指导，人工成像，场景虚拟，现场虚拟。
6、采矿业：在露天矿及金属矿井下作业，以及一些危险区域人员不方便到达的区域。
