illumina IP-202-1012 文库制备试剂盒A

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产品简介

产品名称:illumina IP-202-1012 文库制备试剂盒A 产品货号:IP-202-1012

详细介绍

产品名称:illumina Truseq Chlp Library PreparationKit文库制备试剂盒TruSeq ChlP Library Preparation Kit-Set A

产品货号:IP-202-1012

 

产品说明:

测定时间 从芯片DNA到1.5天

输入量 5 ng芯片dna

系统兼容性 HiSeq 1000,HiSeq 1500,HiSeq 2000HiSeq 2500, HiSeq 3000, HiSeq 4000, 米塞克, 研究模式下的MiSeqDx, NextSeq 500, NextSeq 550

特殊样本类型 低输入样本

物种类别 酵母,老鼠,果蝇,人,斑马鱼,细菌,线虫,任何物种,老鼠,植物

技术 测序

方法 切克

核酸型 脱氧核糖核酸

产品介绍:

illumina Truseq Chlp Library PreparationKit文库制备试剂盒用于Chlp来源DNA的染色质免疫沉淀测序文库制备。大约1.5天完成5ng DNA文库的制备。TruSeq芯片Libary准备试剂盒为从芯片衍生DNA生成染色质免疫沉淀测序(芯片-Seq)库提供了一种简单、成本效益高的解决方案。芯片-seq利用下一代测序(NGS)快速而有效地确定基因组中所关注的dna结合蛋白的分布和丰度。这种方法已成为zui广泛应用的NGS应用之一,使研究人员能够可靠地同时识别整个基因组中广泛目标的结合位点,具有高分辨率和无约束。

 

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Illumina二代测序技术,边合成边测序(SBS),是广泛采用的新一代测序(NGS)技术,负责产生世界上90%以上的测序数据。
Illumina的二代测序技术称为边合成边测序(Sequencing-by-Synthesis,简称SBS)。SBS主要包括碱基延伸、荧光激发及信号收集、剪切等3个步骤。这3个步骤可以重复,循环进行。每循环一次测定一个碱基。想测定多少个碱基(即读长),就循环多少次。测序循环次数可以在软件里设定。到底测序多长合适,要根据项目性质和需求来决定。大多数情况下,SR实验(单端测序)测定1x50个碱基,PE实验(双端测序)测定2x150个碱基。
1 碱基延伸
Illumina测序试剂里所使用的dNTP极ju特色,它们同时具有两个修饰基团:一个荧光基团,一个可逆终止基团。A、G、C、T 4种碱基分别标记4种不同的荧光基团,它们在不同波长的激光激发下,能够发射不同波长(即颜色)的荧光。荧光颜色与碱基种类一一对应,因此根据激发光的波长可以识别碱基。4种碱基的终止基团是一样的。由于终止基团的存在,所有dNTP每次都只能延伸1个碱基,无论给予多长的反应时间。又由于该终止基团是可逆的,在荧光信号收集完毕之后,可以用剪切剂切除该终止基团,使碱基恢复自然的可延伸状态,这时即可继续进行下一轮循环,再测定一个碱基。
可逆终止基团技术是Illumina二代测序的一大特色。它与桥式PCR技术一起,构成了Illumina二代测序的两大支柱,为稳定获得高质量的测序数据打下了坚实的基础。
2 信号采集
HiSeq系列测序仪具有红绿两根激光管,两个滤色片。它们两两组合,可以形成4种不同的激发波长,正好分别用于激发A、G、C、T 4种碱基。
Cluster上所标记的荧光基团在激光激发下产生的信号,可以用相机拍摄或者扫描的方式收集信号。扫描技术速度比较快,被X10系列采用。由于FC面积比较大,而且上表面和下表面要分别拍照,所以拍照过程相当耗时。对于经典的HiSeq 2000来说,一次测序循环所产生的荧光信号,需要大约40分钟的时间才能拍照收集完毕,时间比测序反应本身还要长。
3 剪切
荧光信号收集完毕后,关闭激光,用剪切剂去除测序引物的延伸产物上的碱基所标记的荧光基团和终止基团。两个修饰基团均被切除,一方面消去干扰荧光,一方面使链末端的碱基回复到自然的可延伸状态,为下一轮测序做好准备。
再重复合成、激发、收集等步骤,即可进行第二个碱基的测序。

 

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