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T4 DNA Ligase(Fast)
产品货号:T5205-200U
储存条件:-20℃
产品组成
组分 | 规格 |
T4 DNA Ligase(Fast)(5U/ul) | 40ul |
10×T4 DNA Ligase Buffer | 1ml |
50% PEG | 1ml |
注:1U=1 Weiss unit
产品简介
T4 DNA Ligase(Fast)由携带T4噬菌体gene30的大肠杆菌产生。该酶催化双螺旋DNA或RNA之间的5'-磷酸基团和3'-羟基之间形成磷酸二酯键。该酶在双链DNA、RNA或者DNA/RNA复合物间可修复单链缺刻,并且可以连接有粘性末端或者平末端的DNA片段,但对于单链核酸无活性,主要用于限制性内切酶酶切产物DNA片段克隆、基因定点突变与PCR产物克隆、修复双链DNA缺刻与线性DNA自环化。T4 DNA Ligase(Fast)需要ATP作为辅助因子,在室温下完成粘性末端连接反应仅需10分钟。
酶活单位定义
37℃条件下,1 Weiss unit的酶在20min内催化1nmol的[PPi]转变为活性炭吸附态。1 Weiss unit等同于约200个粘性末端连接反应单位(CEU),相当于在16℃条件下,30min内连接50% HindIII消化后的λDNA片段。
酶活检测条件
酶活在如下反应混合物中进行测试:66mM Tris-HCl(pH7.6),6.6mM MgCl,0.066mM ATP,10mM DTT,3.3μM[32PPi]。
质量控制
核酸量内控切酶制残留测试
37℃条件下,将200U的T4 DNA Ligase(Fast)与1ug的pUC19DNA中温育4h,未检测出共价闭合环状DNA转变为带有缺刻的DNA。
核酸外切酶残留检测
将酶液与双链DNA底物在37℃温育16h,通过DNA电泳检测双链DNA底物无变化。
蓝白斑测试
室温条件下,使用30U T4 DNA Ligase连接pUC57 DNA/HindIII,pUC57 DNA/PstI或pUC57 DNA/SmaI消化产物1h,然后用E.coli XL1-Blue感受态细胞转化连接产物,检测到少于1%的白斑。
使用方法
1.DNA插入片段连接至载体DNA(粘性末端连接)
1)于冰上配制如下反应体系:
试剂 | 使用量 |
线性化载体DNA | 20~100ng |
插入片段DNA | 3:1~10:1(片段:载体摩尔比) |
10×T4 DNA Ligase Buffer | 2ul |
T4 DNA Ligase(Fast) | 1U(0.2ul) |
Nuclease-FreeWater | To 20ul |
2)充分混匀并瞬离,22℃温育10min;
3)取1~5ul的连接产物用于50ul化学感受态细胞的转化,或者取1~2ul用于50ul电转感受态细胞的转化。
注:如果连接反应产物用于电转化,应使用离心柱或者氯仿抽提清洁DNA代替热失活步骤。
2.DNA插入片段连接至载体DNA(平末端连接)
1)于冰上配制如下反应体系:
试剂 | 使用量 |
线性化载体DNA | 20~100ng |
插入片段DNA | 3:1~10:1(片段:载体摩尔比) |
10×T4 DNA Ligase Buffer | 2ul |
50% PEG | 2ul |
T4 DNA Ligase(Fast) | 5U(1ul) |
Nuclease-Free Water | To 20ul |
2)充分混匀并瞬离,22℃温育1h;
3)取1~5ul的连接产物用于50ul化学感受态细胞的转化,或者取1~2ul用于50ul电转感受态细胞的转化。
注:如果连接反应产物用于电转化,应使用离心柱或者氯仿抽提清洁DNA代替热失活步骤。
1. 线性DNA自环化
1)于冰上配制如下反应体系:
试剂 | 使用量 |
线性化DNA | 10~50ng |
10×T4 DNA Ligase Buffer | 5ul |
T4 DNA Ligase(Fast) | 5U(1ul) |
Nuclease-Free Water | To 50ul |
2)彻di混匀并瞬离,22℃温育10min;
3)取1~5ul的连接产物用于50ul化学感受态细胞的转化,或者取1~2ul用于50ul电转感受态细胞的转化。
注:如果连接反应产物用于电转化,应使用离心柱或者氯仿抽提清洁DNA代替热失活步骤。
2.接头连接
双链寡核苷酸接头经常被用于在插入片段上产生粘性末端。接头通常包含限制酶识别位点,在连接后经酶切处理产生和克隆载体匹配的粘端。有时候接头已包含与克隆载体匹配的粘端,此时无需在接头连接完成后进行插入片段的进一步处理。
1)于冰上配制如下反应体系:
试剂 | 使用量 |
线性化DNA | 100~500ng |
磷酸化接头 | 1~2ug |
10×T4 DNA Ligase Buffer | 2ul |
50% PEG | 2ul |
T4 DNA Ligase(Fast) | 2U(0.4ul) |
Nuclease-Free Water | To 20ul |
2)彻di混匀并瞬离,22℃温育10min;
3)在65℃作用10min或者70℃作用5min,进行热失活。
注:添加1mM ATP的条件下,T4 DNA Ligase(Fast)在LabFD™酶切缓冲液中具有100%活性。因此,接头连接反应时可以在LabFD™酶切缓冲液中进行,以简化“接头连接-酶切”实验流程。具体方法为:接头连接反应完成后,先失活T4 DNA Ligase,然后向该体系中添加ATP至终浓度1mM,再在体系中加入适量的LabFD™快速内切酶,最后使用最适酶切反应温度进行温育即可。
注意事项
1)T4 DNA Ligase在浓度高于200mM的NaCl或KCl中会被强烈抑制;
2)连接反应液添加量不应该超过感受态细胞体积的10%,不推荐体系中加入过量的T4 DNA Ligase;
3)与T4 DNA Ligase结合的DNA可能会在琼脂糖凝胶中出现带移或弥散,为了避免此现象,可以在上样前对酶进行热失活,必要时加入适量的SDS;
4)聚乙二醇(PEG)能极大地提高平末端连接的连接效率,PEG8000的推荐添加量是连接体系的5%(w/v);
5)电转化效率可能通过对T4 DNA Ligase热失活或者使用离心柱或者氯仿抽提纯化DNA方式来提高;
6)转化子数目可通过延长反应时间至1h而增加。