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丙酮酸磷酸双激酶(PPDK)活性检测试剂盒说明书
紫外分光光度法
货号:BC5850
规格:50T/48S
产品组成:使用前请认真核对试剂体积与瓶内体积是否一致,有疑问请及时联系索莱宝工作人员。
试剂名称 | 规格 | 保存条件 |
提取液 | 液体60 mL×1瓶 | 2-8℃保存 |
试剂一 | 液体40 mL×1瓶 | 2-8℃保存 |
试剂二 | 粉剂×1瓶 | -20℃保存 |
液体3 mL×1瓶 | 2-8℃保存 | |
试剂四 | 粉剂×1瓶 | 2-8℃保存 |
试剂五 | 粉剂×1瓶 | -20℃保存 |
试剂六 | 液体120 μL×1支 | 2-8℃保存 |
溶液的配制:
1、 试剂二:临用前加入3mL蒸馏水充分溶解,未用完的试剂-20℃分装保存4周,避免反复冻融。
2、 试剂四:临用前加入3mL蒸馏水充分溶解,未用完的试剂-20℃分装保存4周,避免反复冻融。
3、 试剂五:临用前加入3.1mL蒸馏水充分溶解,未用完的试剂-20℃分装保存4周,避免反复冻融。
4、 试剂六工作液:临用根据样本量按照试剂六:蒸馏水=20μL:480μL(共0.5mL,10T)的比例配制成,现配现用。
5、 工作液的配制:临用前按样本量将试剂二:试剂三:试剂四:试剂五:试剂六工作液=0.5mL:0.5mL:0.5mL:0.5mL:0.5mL(共2.5mL,约10T)配制成工作液使用,现配现用。
产品说明:
丙酮酸磷酸双激酶(pyruvate phosphate dikinase,PPDK,EC 2.7.9.1)是C4途径和景天科酸代谢途径的限速酶,催化ATP、丙酮酸和Pi经三步反应生成磷酸烯醇式丙酮酸。该酶主要存在于C4植物的叶绿体基质中,对光合功能具有重要调节作用。
PPDK的逆向反应催化磷酸烯醇式丙酮酸(PEP)、AMP和PPi生成丙酮酸、ATP和Pi,乳酸脱氢酶(LDH)进一步催化丙酮酸和NADH生成乳酸和NAD+,在340nm测定NADH减少速率,据此可以计算PPDK活性。
注意:实验之前建议选择2-3个预期差异大的样本做预实验。如果样本吸光值不在测量范围内建议稀释或者增加样本量进行检测。
需自备的仪器和用品:
紫外分光光度计、1mL石英比色皿、天平、低温离心机、水浴锅、研钵/匀浆器、冰和蒸馏水。
操作步骤:
一、样本处理(可适当调整待测样本量,具体比例可以参考文献)
1. 组织:按照组织质量(g):提取液体积(mL)为1:5~10的比例(建议称取约0.1g组织,加入1mL提取液)
进行冰浴匀浆。12000g,4℃离心 10min,取上清置于冰上待测。
二、测定步骤
1、 紫外分光光度计预热30min以上,调节波长至340nm。蒸馏水调零
2、 试剂一37℃预热10min。
3、 样本测定(在1mL石英比色皿/1.5mL EP管中加入下列试剂)
试剂名称(μL) | 空白管 | 测定管 |
试剂一 | 650 | 650 |
工作液 | 250 | 250 |
样本 | - | 100 |
提取液 | 100 | - |
在石英比色皿/1.5mL EP管中分别加入上述试剂,充分混匀后记录340nm下10s时的初始吸光度A1空白、A1测定,之后迅速将比色皿连同反应液一起置于37℃水浴中准确反应5min,迅速取出比色皿并擦干,340nm下记录5min10s时的吸光度A空白2、A测定2,计算ΔA测定=A测定1-A测定2,ΔA空白=A空白1-A空白2,ΔA=ΔA测定-ΔA空白。空白管只需做1-2次。 |
注:在1.5mL EP管中进行反应时,可参考以下步骤:先将比色皿置于分光光度计中,将反应液混匀后迅速加入1mL石英比色皿中,记录340nm下10s时的初始吸光度A1空白、A1测定,之后迅速将反应液吸取到1.5mL EP管中,置于37℃水浴中准确反应5min,迅速取出EP管并擦干,340nm下记录5min10s时的吸光度A2空白、A2测定。
三、丙酮酸磷酸双激酶(PPDK)计算公式
1. 按样本蛋白浓度计算:
酶活定义:每mg组织蛋白在反应体系中每分钟减少1nmol NADH定义为一个酶活力单位。
PPDK活性(U/mg prot)=ΔA÷(ε×d)×V反×109÷(Cpr×V样)÷T×F =321.54×ΔA÷Cpr×F
2. 按样本质量计算:
酶活定义:每g组织在反应体系中每分钟减少1nmol NADH定义为一个酶活力单位。
PPDK活性(U/g 质量)=ΔA÷(ε×d)×V反×109÷(W÷V提取×V样)÷T×F =321.54×ΔA÷W×F
ε:NADH摩尔消光系数,6.22×103 L/(mol·cm);d:比色皿光径,1cm;V反:反应体系体积,1×10-3L;V样:反应体系中加入的样本体积,0.1mL;V提取:加入提取液的体积,1mL;T:反应时间,5min;Cpr:样本蛋白浓度,mg/mL;W:样本质量,g;F:稀释倍数;109:单位换算,1mol=109nmol。
注意事项:
1. 测定过程中样本和工作液在冰上放置,以免变性和失活。
2. 最好两个人同时做此实验,一个人比色,一个人计时,以保证实验结果的准确性。
3. 当样本ΔA<0.005时,可适当延长酶促反应时间或增大样本量后测定;当样本ΔA>0.6或A1测定<A1空白时,可用蒸馏水稀释上清液后测定,注意同步修改计算公式中的稀释倍数。
实验实例:
1、 取0.1019g水稻叶片加入1mL提取液进行冰浴匀浆,取上清按照测定步骤操作,用1mL石英比色皿测得ΔA空白=A空白1-A空白2=0.700-0.695=0.005,ΔA测定=A测定1-A测定2=1.358-1.073=0.285,ΔA=ΔA测定-
ΔA空白=0.285-0.005=0.280,按样本质量计算PPDK活性得:
PPDK活性(U/g 质量)= 321.54×ΔA÷W×F =883.53 U/g 质量。
2、 取0.1086g柚子叶片加入1mL提取液进行冰浴匀浆,取上清用蒸馏水稀释4倍后,按照测定步骤操作,用1mL石英比色皿测得ΔA空白=A空白1-A空白2=0.700-0.695=0.005,ΔA测定=A测定1-A测定2=1.217-1.064=0.153,ΔA=ΔA测定-ΔA空白=0.153-0.005=0.148,按样本质量计算PPDK活性得:
PPDK活性(U/g 质量)= 321.54×ΔA÷W×F =1752.8 U/g 质量。
参考文献:
[1] Chris J. Chastain and others, Functional evolution of C4 pyruvate, orthophosphate dikinase, Journal of Experimental Botany, Volume 62, Issue 9, May 2011, Pages 3083–3091.
[2] Chastain, C.J., Heck, J.W., Colquhoun, T.A. et al. Posttranslational regulation of pyruvate, orthophosphate dikinase in developing rice (Oryza sativa) seeds. Planta 224, 924–934 (2006).
[3] Aoyagi K, Bassham JA. Pyruvate orthophosphate dikinase in wheat leaves. Plant Physiol. 1983 Nov;73(3):853-4.
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