Yeasen/翌圣生物 品牌
生产厂家厂商性质
上海市所在地
Hieff NGS™ DNA分选磁珠
面议Hieff NGS® Ultima Pro PCR Free DNA Library Pr
¥2475Hieff NGSTM mRNA Isolation Master Kit
面议phi29 DNA Polymerase (10 U/μL)
¥585Recombinant Ten-Eleven Translocase
¥1555Recombinant Ten-Eleven Translocase (TET)14
¥1555Recombinant APOBEC3A (A3A) Protein
¥13354×Multiplex PCR Master Mix for Pathogen
¥725Hieff NGS® G-Type In-Situ DNA Binding Profili
¥2855Hieff Canace® Uracil+ High-Fidelity DNA polym
¥3015E. coli DNA ligase (60 U/μL)
¥554× Frag/Prime Buffer
¥102产品信息
产品名称 | 产品编号 | 规格 | 价格/元 | */元 |
Hieff NGS® Stubby UDI Primer Kit for Illumina® (12 Index)文库构建专用接头试剂盒是 | 12404ES01 | 12×2 T | 515.00 | 489.00 |
Hieff NGS® Stubby UDI Primer Kit for Illumina® (96 Index)文库构建专用接头试剂盒是 | 12405ES01 | 96×2 T | 4135.00 | 3928.00 |
Hieff NGS® Stubby UDI Primer Kit for Illumina® (192 Index)文库构建专用接头试剂盒是 | 12406ES01 | 192×1 T | 8160.00 | 7743.84 |
Hieff NGS® Stubby UDI Primer Kit for Illumina® (384 Index)文库构建专用接头试剂盒是 | 12407ES01 | 384×1 T | 16320.00 | 15487.68 |
产品描述
文库构建专用接头试剂盒是Hieff NGS® Stubby UDI Primer Kit for Illumina®是Illumina高通量测序平台文库构建专用接头试剂盒,包含二代测序建库中使用的PE adapter以及12/96/192/384种UDI Primer。该试剂盒提供的UDI Primer为I5、I7 Primer预混液,配合DNA Library Prep Kit for Illumina®使用,可构建多达384种双端Index标记的文库。试剂盒中提供的所有试剂都经过严格的质量控制和功能验证,上保证了文库构建的稳定性和重复性。
产品组分
编号 | 名称 | 规格 |
12404ES01 | PE Adapter | 84 μL |
UDI Primer 0001-0012 | 10 μL each | |
12405ES01 | PE Adapter | 2×336 μL |
UDI Primer 0001-0096 | 10 μL each | |
12406ES01 | PE Adapter | 2×336 μL |
UDI Primer 0001-0192 | 5 μL each | |
12407ES01 | PE Adapter | 4×336 μL |
UDI Primer 0001-0384 | 5 μL each |
运输与保存方法
冰袋运输。所有组分-20°C保存,有效期1年。
注意事项
1)本试剂盒中DNA Adapter的浓度为15 μM,单个文库构建的接头使用量根据所用试剂盒进行调整。
2)本试剂盒提供的PE Adapter为通用型短接头,需要通过PCR扩增获得完整的文库。UDI Primer提供Barcode序列标签,用于高通量测序时区分样品。
3)本试剂盒有四种规格,分别提供12/96/192/384种UDI Primer,可以构建多达384种双端Index标记文库。
4)切勿加热接头,应在室温让其缓慢溶解,实验室温度最好设置为20-25°C。接头避免反复冻融,建议分装保存,可短暂存放于4°C。
5)使用Hieff NGS® Stubby UDI Primer Kit for Illumina®试剂盒构建的DNA文库结构如下:
6)为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。
7)本产品仅作科研用途!
使用方法
本试剂盒使用方法按照 Hieff NGS ® MaxUp II DNA Library Prep Kit for Illumina® 试剂盒操作说明进行。
接头连接 (Adapter Ligation)
在末端修复产物两端连接特定的Illumina®接头,即Hieff NGS® MaxUp II DNA Library Prep Kit for Illumina®操作步骤3.2。
1. 根据Input DNA量按照下表1选择合适的Adapter用量;
表1 不同Input DNA推荐的Adapter使用浓度
Input DNA | Adapter : Input DNA摩尔比 | 推荐Adapter(15 μM)使用量 |
400 ng | 30:1 | 3.5 μL |
300 ng | 40:1 | 3.5 μL |
200 ng | 60:1 | 3.5 μL |
100 ng | 100:1 | 3.0 μL |
50 ng | 100:1 | 1.5 μL |
【注】:Input DNA 摩尔数 (pmol)≈Input DNA质量(ng)/[0.66×Input DNA平均长度 (bp)]
2. 将表2中的各种试剂解冻后颠倒混匀,置于冰上备用;
3. 配制表2所示反应体系;
表2 Adapter Ligation反应体系
名称 | 体积 (μL) |
dA-tailed DNA | 60 |
Ligation Enhancer | 30* |
Quick T4 DNA Ligase | 5 |
PE Adapter | x** |
ddH2O | 5-x |
【注】:*Ligation Enhancer比较粘稠,请上下颠倒、振荡,充分混匀并瞬时后离心使用。
**本公司接头浓度 (Cat#12404;Cat#12405;Cat#12406;Cat#12407)与常规商业化试剂盒一致,皆为15 μmol/L。
4. 使用移液器轻轻吹打或振荡混匀,并短暂离心将反应液收集至管底;
5. 将PCR管置于PCR仪中,设置表3所示反应程序,进行接头连接反应:
表3 Adapter Ligation反应程序
温度 | 时间 |
热盖 | Off |
20°C | 15 min |
4°C | Hold |
【注】:当Input DNA量较低,实验效果不理想时,可尝试将连接时间延长一倍。
连接产物磁珠纯化 (Post Ligation Clean Up)
该步骤使用磁珠对连接产物进行纯化或分选。纯化可除去未连接的Adapter或Adapter Dimer等无效产物,分选可筛选特定长度DNA片段以符合测序需要,详细操作步骤参照Hieff NGS® MaxUp II DNA Library Prep Kit for Illumina®建库试剂盒说明书。
文库扩增 (Library Amplification)
该步骤将对纯化或长度分选后的接头连接产物进行PCR扩增富集,使用本试剂盒接头时,该步骤为必做步骤;
1. 将表4中试剂解冻后颠倒混匀,置于冰上备用;
2. 于无菌PCR管中配制表4所示反应体系;
表4 PCR扩增反应体系
名称 | 体积 (μL) |
2× Super Canace® II High-Fidelity Mix | 25 |
UDI Primer | 5 |
Adapter Ligated DNA | 20 |
【注】:文库扩增引物来自Yeasen接头引物试剂盒 (Cat#12404;Cat#12405;Cat#12406;Cat#12407)。
3. 使用移液器轻轻吹打或振荡混匀,并短暂离心将反应液收集至管底;
4. 将PCR管置于PCR仪中,设置表5所示反应程序,进行PCR扩增:
表5 PCR扩增反应程序
温度 | 时间 | 循环数 |
98°C | 1 min | 1 |
98°C |
| 根据实验需要调整 |
60°C | 30 sec | |
72°C | 30 sec | |
72°C | 5 min | 1 |
4°C | Hold | - |
HB210809